Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf1P15314 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf1P15314 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf1P15314 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf1P15314 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf1P15314 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irf1P15314 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms