Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vpreb2P13373 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb2P13373 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms