Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timp1P12032 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timp1P12032 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timp1P12032 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timp1P12032 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timp1P12032 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timp1P12032 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timp1P12032 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timp1P12032 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timp1P12032 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Timp1P12032 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timp1P12032 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timp1P12032 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timp1P12032 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timp1P12032 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timp1P12032 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timp1P12032 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timp1P12032 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timp1P12032 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timp1P12032 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Timp1P12032 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timp1P12032 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timp1P12032 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timp1P12032 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timp1P12032 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timp1P12032 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Timp1P12032 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Timp1P12032 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Timp1P12032 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Timp1P12032 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms