Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OtcP11725 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OtcP11725 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OtcP11725 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OtcP11725 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OtcP11725 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OtcP11725 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OtcP11725 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OtcP11725 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OtcP11725 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OtcP11725 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OtcP11725 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OtcP11725 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OtcP11725 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OtcP11725 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OtcP11725 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OtcP11725 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OtcP11725 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OtcP11725 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OtcP11725 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OtcP11725 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OtcP11725 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OtcP11725 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OtcP11725 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OtcP11725 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OtcP11725 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OtcP11725 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OtcP11725 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OtcP11725 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OtcP11725 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OtcP11725 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OtcP11725 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OtcP11725 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OtcP11725 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OtcP11725 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OtcP11725 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OtcP11725 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OtcP11725 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OtcP11725 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OtcP11725 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OtcP11725 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OtcP11725 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OtcP11725 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OtcP11725 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OtcP11725 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OtcP11725 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OtcP11725 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OtcP11725 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OtcP11725 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OtcP11725 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OtcP11725 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OtcP11725 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OtcP11725 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OtcP11725 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OtcP11725 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OtcP11725 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OtcP11725 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OtcP11725 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OtcP11725 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OtcP11725 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
OtcP11725 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OtcP11725 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OtcP11725 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OtcP11725 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OtcP11725 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OtcP11725 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OtcP11725 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OtcP11725 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OtcP11725 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OtcP11725 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OtcP11725 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OtcP11725 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OtcP11725 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OtcP11725 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OtcP11725 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OtcP11725 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OtcP11725 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OtcP11725 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OtcP11725 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OtcP11725 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OtcP11725 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OtcP11725 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OtcP11725 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OtcP11725 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OtcP11725 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OtcP11725 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OtcP11725 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OtcP11725 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OtcP11725 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OtcP11725 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OtcP11725 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OtcP11725 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OtcP11725 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OtcP11725 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
OtcP11725 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OtcP11725 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OtcP11725 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OtcP11725 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OtcP11725 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OtcP11725 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms