Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga5P11688 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga5P11688 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Itga5P11688 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga5P11688 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga5P11688 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga5P11688 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga5P11688 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga5P11688 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms