Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col1a1P11087 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Col1a1P11087 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms