Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd4P10628 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd4P10628 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms