Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CatspereP0DP43 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CatspereP0DP43 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms