Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtaP09225 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtaP09225 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtaP09225 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtaP09225 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtaP09225 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtaP09225 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtaP09225 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtaP09225 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtaP09225 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtaP09225 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtaP09225 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtaP09225 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LtaP09225 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LtaP09225 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtaP09225 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtaP09225 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtaP09225 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtaP09225 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtaP09225 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtaP09225 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtaP09225 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtaP09225 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtaP09225 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtaP09225 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtaP09225 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LtaP09225 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtaP09225 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtaP09225 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LtaP09225 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtaP09225 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtaP09225 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtaP09225 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtaP09225 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtaP09225 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtaP09225 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtaP09225 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LtaP09225 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtaP09225 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtaP09225 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtaP09225 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtaP09225 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtaP09225 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtaP09225 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtaP09225 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtaP09225 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtaP09225 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtaP09225 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtaP09225 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtaP09225 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LtaP09225 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LtaP09225 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LtaP09225 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtaP09225 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtaP09225 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtaP09225 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtaP09225 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtaP09225 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtaP09225 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtaP09225 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtaP09225 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtaP09225 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtaP09225 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtaP09225 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtaP09225 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtaP09225 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtaP09225 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LtaP09225 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtaP09225 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtaP09225 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtaP09225 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtaP09225 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtaP09225 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtaP09225 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtaP09225 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtaP09225 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtaP09225 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtaP09225 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtaP09225 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtaP09225 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtaP09225 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtaP09225 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtaP09225 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LtaP09225 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtaP09225 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtaP09225 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtaP09225 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtaP09225 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtaP09225 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtaP09225 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtaP09225 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtaP09225 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtaP09225 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtaP09225 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtaP09225 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtaP09225 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LtaP09225 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtaP09225 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtaP09225 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtaP09225 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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