Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa5P09021 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa5P09021 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms