Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NefmP08553 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NefmP08553 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NefmP08553 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NefmP08553 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NefmP08553 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NefmP08553 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NefmP08553 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NefmP08553 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NefmP08553 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NefmP08553 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NefmP08553 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NefmP08553 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NefmP08553 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NefmP08553 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NefmP08553 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NefmP08553 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NefmP08553 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NefmP08553 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NefmP08553 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NefmP08553 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NefmP08553 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NefmP08553 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NefmP08553 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NefmP08553 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NefmP08553 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NefmP08553 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NefmP08553 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NefmP08553 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NefmP08553 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NefmP08553 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NefmP08553 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NefmP08553 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NefmP08553 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NefmP08553 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NefmP08553 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NefmP08553 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NefmP08553 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NefmP08553 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NefmP08553 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NefmP08553 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NefmP08553 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NefmP08553 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NefmP08553 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NefmP08553 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NefmP08553 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NefmP08553 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NefmP08553 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NefmP08553 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NefmP08553 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NefmP08553 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NefmP08553 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NefmP08553 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NefmP08553 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NefmP08553 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NefmP08553 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NefmP08553 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NefmP08553 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NefmP08553 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NefmP08553 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NefmP08553 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NefmP08553 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NefmP08553 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NefmP08553 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NefmP08553 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NefmP08553 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NefmP08553 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NefmP08553 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NefmP08553 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NefmP08553 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NefmP08553 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NefmP08553 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NefmP08553 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NefmP08553 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NefmP08553 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NefmP08553 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NefmP08553 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NefmP08553 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NefmP08553 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NefmP08553 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NefmP08553 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NefmP08553 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NefmP08553 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NefmP08553 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NefmP08553 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NefmP08553 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NefmP08553 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NefmP08553 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NefmP08553 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NefmP08553 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NefmP08553 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NefmP08553 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NefmP08553 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NefmP08553 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NefmP08553 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NefmP08553 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NefmP08553 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NefmP08553 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NefmP08553 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NefmP08553 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms