Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Egr1P08046 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Egr1P08046 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Egr1P08046 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Egr1P08046 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Egr1P08046 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Egr1P08046 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Egr1P08046 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Egr1P08046 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Egr1P08046 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms