Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P06321 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P06321 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P06321 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P06321 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P06321 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P06321 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P06321 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P06321 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P06321 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P06321 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06321 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06321 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06321 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06321 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
P06321 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06321 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06321 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06321 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06321 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06321 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06321 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06321 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P06321 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P06321 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P06321 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P06321 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P06321 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P06321 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P06321 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P06321 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P06321 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P06321 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P06321 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P06321 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P06321 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P06321 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P06321 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P06321 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P06321 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P06321 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
P06321 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P06321 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P06321 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P06321 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P06321 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P06321 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P06321 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P06321 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
P06321 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
P06321 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
P06321 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P06321 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P06321 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P06321 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P06321 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P06321 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P06321 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P06321 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06321 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06321 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
P06321 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06321 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06321 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06321 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06321 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
P06321 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06321 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06321 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06321 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06321 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06321 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P06321 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06321 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06321 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06321 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06321 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06321 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06321 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06321 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06321 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06321 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06321 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06321 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
P06321 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06321 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06321 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
P06321 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06321 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06321 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06321 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06321 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06321 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P06321 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P06321 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P06321 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P06321 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P06321 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P06321 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P06321 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms