Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Eb1P04230 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Eb1P04230 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms