Protein–RNA interactions for Protein: P04219

Putative uncharacterized Ig-region protein, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04219 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04219 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04219 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04219 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04219 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04219 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04219 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P04219 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04219 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04219 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04219 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04219 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04219 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04219 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04219 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P04219 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04219 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04219 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04219 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04219 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04219 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04219 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04219 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04219 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04219 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04219 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04219 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04219 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04219 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04219 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P04219 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04219 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04219 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P04219 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04219 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04219 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04219 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P04219 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04219 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04219 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04219 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04219 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04219 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04219 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04219 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04219 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04219 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04219 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04219 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04219 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P04219 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04219 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04219 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04219 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04219 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04219 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04219 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04219 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04219 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04219 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04219 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04219 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04219 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04219 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04219 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P04219 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P04219 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P04219 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P04219 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P04219 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P04219 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P04219 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P04219 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P04219 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P04219 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P04219 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P04219 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P04219 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
P04219 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P04219 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P04219 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P04219 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P04219 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P04219 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P04219 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P04219 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P04219 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P04219 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P04219 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P04219 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P04219 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P04219 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P04219 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P04219 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P04219 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P04219 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P04219 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P04219 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P04219 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P04219 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms