Protein–RNA interactions for Protein: P01803

Ig heavy chain V region AMPC1, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01803 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01803 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01803 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01803 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01803 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01803 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01803 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01803 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01803 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01803 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01803 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01803 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01803 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01803 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01803 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01803 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01803 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01803 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01803 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01803 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01803 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01803 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01803 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01803 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01803 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01803 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01803 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01803 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01803 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01803 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01803 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01803 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01803 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01803 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01803 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01803 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01803 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01803 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01803 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01803 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01803 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01803 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01803 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01803 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01803 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01803 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01803 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01803 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01803 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01803 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01803 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01803 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01803 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01803 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01803 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01803 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01803 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01803 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01803 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01803 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01803 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01803 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01803 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01803 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01803 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01803 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01803 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01803 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01803 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01803 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01803 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01803 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01803 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01803 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01803 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01803 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms