Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01790 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01790 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01790 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01790 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01790 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01790 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01790 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01790 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01790 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01790 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01790 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01790 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01790 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01790 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01790 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01790 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01790 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01790 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01790 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01790 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01790 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01790 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01790 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01790 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01790 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01790 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01790 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01790 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01790 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01790 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01790 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01790 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01790 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01790 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01790 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01790 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01790 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01790 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01790 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01790 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01790 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01790 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01790 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01790 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01790 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01790 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01790 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01790 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01790 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01790 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01790 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01790 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01790 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01790 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01790 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01790 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01790 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01790 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01790 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01790 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01790 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01790 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01790 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01790 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01790 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01790 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01790 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01790 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01790 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01790 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01790 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01790 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01790 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01790 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01790 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01790 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms