Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01789 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01789 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01789 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01789 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01789 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01789 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01789 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01789 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01789 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01789 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01789 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01789 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01789 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01789 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01789 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01789 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01789 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01789 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01789 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01789 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01789 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01789 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01789 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01789 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01789 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01789 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01789 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01789 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01789 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01789 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01789 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01789 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01789 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01789 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01789 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01789 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01789 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01789 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01789 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01789 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01789 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01789 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01789 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01789 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01789 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01789 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01789 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01789 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01789 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01789 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01789 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01789 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01789 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01789 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01789 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01789 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01789 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01789 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01789 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01789 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01789 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01789 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01789 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01789 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01789 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01789 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01789 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01789 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01789 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01789 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01789 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01789 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01789 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01789 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01789 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01789 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01789 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01789 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01789 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01789 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01789 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01789 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01789 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01789 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01789 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01789 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01789 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01789 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01789 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01789 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01789 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01789 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01789 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01789 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01789 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01789 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01789 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01789 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01789 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms