Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01788 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01788 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01788 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01788 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01788 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01788 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01788 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01788 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01788 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01788 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01788 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01788 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01788 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01788 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01788 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01788 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01788 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01788 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01788 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01788 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01788 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01788 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01788 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01788 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01788 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01788 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01788 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01788 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01788 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01788 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01788 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01788 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01788 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01788 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01788 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01788 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01788 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01788 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01788 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01788 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01788 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01788 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01788 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01788 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01788 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01788 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01788 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01788 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01788 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01788 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01788 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01788 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01788 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01788 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01788 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01788 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01788 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01788 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01788 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01788 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01788 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01788 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01788 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01788 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01788 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01788 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01788 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01788 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01788 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01788 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01788 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01788 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01788 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01788 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01788 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01788 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01788 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01788 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01788 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01788 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01788 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01788 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01788 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01788 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01788 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01788 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01788 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01788 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01788 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01788 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01788 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01788 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01788 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01788 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01788 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01788 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01788 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01788 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01788 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms