Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01643 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01643 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01643 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01643 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01643 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01643 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01643 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01643 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01643 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01643 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01643 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01643 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01643 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01643 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01643 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01643 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01643 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01643 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01643 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01643 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01643 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01643 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01643 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01643 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01643 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01643 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01643 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01643 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01643 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01643 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01643 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01643 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01643 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01643 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01643 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01643 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01643 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01643 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01643 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01643 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01643 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01643 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01643 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01643 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01643 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01643 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01643 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01643 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01643 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01643 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01643 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01643 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01643 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01643 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01643 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01643 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01643 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01643 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01643 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01643 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01643 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01643 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01643 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01643 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01643 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01643 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01643 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01643 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01643 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01643 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01643 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01643 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01643 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01643 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01643 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01643 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01643 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01643 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01643 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01643 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01643 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01643 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01643 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01643 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01643 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01643 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01643 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01643 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01643 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01643 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01643 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01643 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01643 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01643 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01643 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01643 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01643 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01643 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01643 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms