Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtatp6P00848 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mtatp6P00848 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms