Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccl20O89093 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ccl20O89093 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl20O89093 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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