Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tcn2O88968 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcn2O88968 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcn2O88968 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms