Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hcn2O88703 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hcn2O88703 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hcn2O88703 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hcn2O88703 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Hcn2O88703 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hcn2O88703 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hcn2O88703 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hcn2O88703 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Hcn2O88703 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hcn2O88703 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hcn2O88703 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hcn2O88703 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hcn2O88703 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms