Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema3fO88632 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema3fO88632 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms