Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sap30O88574 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sap30O88574 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sap30O88574 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sap30O88574 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sap30O88574 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sap30O88574 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sap30O88574 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sap30O88574 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sap30O88574 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms