Protein–RNA interactions for Protein: O88561

Slc27a3, Long-chain fatty acid transport protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a3O88561 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc27a3O88561 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc27a3O88561 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms