Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cops3O88543 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cops3O88543 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops3O88543 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops3O88543 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops3O88543 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops3O88543 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops3O88543 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops3O88543 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cops3O88543 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms