Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme6O88425 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme6O88425 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme6O88425 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme6O88425 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme6O88425 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme6O88425 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme6O88425 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme6O88425 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme6O88425 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme6O88425 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme6O88425 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme6O88425 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme6O88425 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms