Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnnt1O88346 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnnt1O88346 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnnt1O88346 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
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