Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nid2O88322 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nid2O88322 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nid2O88322 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nid2O88322 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nid2O88322 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nid2O88322 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Nid2O88322 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nid2O88322 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nid2O88322 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nid2O88322 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nid2O88322 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nid2O88322 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms