Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ly86O88188 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly86O88188 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly86O88188 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly86O88188 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly86O88188 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly86O88188 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly86O88188 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly86O88188 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly86O88188 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly86O88188 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly86O88188 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly86O88188 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly86O88188 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms