Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Itgb5O70309 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb5O70309 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb5O70309 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms