Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lnx1O70263 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lnx1O70263 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lnx1O70263 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lnx1O70263 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lnx1O70263 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lnx1O70263 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lnx1O70263 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms