Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FiglaO55208 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FiglaO55208 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FiglaO55208 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FiglaO55208 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FiglaO55208 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms