Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syngr2O55101 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syngr2O55101 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms