Protein–RNA interactions for Protein: O55091

Impact, Protein IMPACT, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ImpactO55091 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ImpactO55091 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ImpactO55091 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ImpactO55091 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ImpactO55091 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ImpactO55091 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ImpactO55091 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ImpactO55091 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ImpactO55091 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ImpactO55091 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ImpactO55091 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ImpactO55091 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ImpactO55091 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ImpactO55091 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ImpactO55091 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms