Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn20O55082 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptpn20O55082 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms