Protein–RNA interactions for Protein: O55038

Cxcl13, C-X-C motif chemokine 13, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl13O55038 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl13O55038 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl13O55038 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms