Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc3O55013 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc3O55013 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms