Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema6bO54951 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sema6bO54951 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sema6bO54951 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms