Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dnajb6O54946 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajb6O54946 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnajb6O54946 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnajb6O54946 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnajb6O54946 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnajb6O54946 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnajb6O54946 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnajb6O54946 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnajb6O54946 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnajb6O54946 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnajb6O54946 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajb6O54946 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajb6O54946 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajb6O54946 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajb6O54946 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajb6O54946 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajb6O54946 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajb6O54946 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajb6O54946 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajb6O54946 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajb6O54946 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajb6O54946 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms