Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CrxO54751 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CrxO54751 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CrxO54751 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CrxO54751 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CrxO54751 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CrxO54751 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CrxO54751 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CrxO54751 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CrxO54751 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CrxO54751 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CrxO54751 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CrxO54751 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CrxO54751 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CrxO54751 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CrxO54751 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CrxO54751 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CrxO54751 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CrxO54751 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CrxO54751 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CrxO54751 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CrxO54751 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CrxO54751 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CrxO54751 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CrxO54751 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CrxO54751 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CrxO54751 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CrxO54751 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CrxO54751 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CrxO54751 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CrxO54751 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CrxO54751 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CrxO54751 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CrxO54751 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CrxO54751 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CrxO54751 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CrxO54751 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CrxO54751 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CrxO54751 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CrxO54751 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CrxO54751 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CrxO54751 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CrxO54751 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CrxO54751 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CrxO54751 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CrxO54751 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CrxO54751 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CrxO54751 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CrxO54751 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CrxO54751 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CrxO54751 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CrxO54751 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CrxO54751 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CrxO54751 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CrxO54751 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CrxO54751 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CrxO54751 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CrxO54751 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CrxO54751 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CrxO54751 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CrxO54751 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CrxO54751 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CrxO54751 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CrxO54751 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CrxO54751 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CrxO54751 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CrxO54751 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CrxO54751 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CrxO54751 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CrxO54751 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CrxO54751 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CrxO54751 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CrxO54751 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CrxO54751 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CrxO54751 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CrxO54751 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CrxO54751 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CrxO54751 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CrxO54751 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CrxO54751 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CrxO54751 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CrxO54751 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CrxO54751 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CrxO54751 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CrxO54751 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CrxO54751 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CrxO54751 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CrxO54751 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CrxO54751 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CrxO54751 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CrxO54751 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CrxO54751 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CrxO54751 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CrxO54751 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CrxO54751 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CrxO54751 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CrxO54751 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CrxO54751 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CrxO54751 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CrxO54751 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.5 ms