Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Timm44O35857 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Timm44O35857 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Timm44O35857 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Timm44O35857 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Timm44O35857 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Timm44O35857 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Timm44O35857 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Timm44O35857 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Timm44O35857 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Timm44O35857 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Timm44O35857 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms