Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited2O35740 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited2O35740 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited2O35740 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited2O35740 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cited2O35740 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cited2O35740 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited2O35740 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited2O35740 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited2O35740 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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