Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf9O35739 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf9O35739 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf9O35739 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Klf9O35739 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf9O35739 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf9O35739 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf9O35739 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf9O35739 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf9O35739 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms