Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
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Tnfrsf18O35714 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfrsf18O35714 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Tnfrsf18O35714 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfrsf18O35714 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf18O35714 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf18O35714 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf18O35714 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf18O35714 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf18O35714 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf18O35714 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf18O35714 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Tnfrsf18O35714 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Tnfrsf18O35714 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf18O35714 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf18O35714 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf18O35714 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Tnfrsf18O35714 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Tnfrsf18O35714 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Tnfrsf18O35714 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Tnfrsf18O35714 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Tnfrsf18O35714 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Tnfrsf18O35714 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnfrsf18O35714 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Tnfrsf18O35714 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Tnfrsf18O35714 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Tnfrsf18O35714 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Tnfrsf18O35714 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Tnfrsf18O35714 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Tnfrsf18O35714 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf18O35714 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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