Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1dO35473 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1dO35473 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1dO35473 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1dO35473 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1dO35473 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1dO35473 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1dO35473 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1dO35473 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1dO35473 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1dO35473 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1dO35473 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1dO35473 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1dO35473 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1dO35473 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1dO35473 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1dO35473 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1dO35473 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1dO35473 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1dO35473 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1dO35473 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1dO35473 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1dO35473 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1dO35473 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1dO35473 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1dO35473 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1dO35473 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1dO35473 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1dO35473 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1dO35473 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1dO35473 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1dO35473 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1dO35473 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1dO35473 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1dO35473 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1dO35473 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1dO35473 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1dO35473 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1dO35473 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1dO35473 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1dO35473 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1dO35473 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1dO35473 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1dO35473 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C1dO35473 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1dO35473 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1dO35473 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1dO35473 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1dO35473 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1dO35473 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1dO35473 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1dO35473 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1dO35473 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1dO35473 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1dO35473 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1dO35473 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1dO35473 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1dO35473 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1dO35473 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1dO35473 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1dO35473 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1dO35473 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1dO35473 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1dO35473 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1dO35473 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1dO35473 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1dO35473 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1dO35473 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1dO35473 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1dO35473 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1dO35473 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1dO35473 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1dO35473 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1dO35473 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1dO35473 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1dO35473 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1dO35473 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1dO35473 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1dO35473 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1dO35473 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1dO35473 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1dO35473 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1dO35473 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1dO35473 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1dO35473 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1dO35473 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1dO35473 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1dO35473 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1dO35473 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1dO35473 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1dO35473 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1dO35473 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1dO35473 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1dO35473 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1dO35473 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1dO35473 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1dO35473 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1dO35473 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1dO35473 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1dO35473 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms