Protein–RNA interactions for Protein: O35393

Efnb3, Ephrin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb3O35393 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Efnb3O35393 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Efnb3O35393 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms