Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kpna6O35345 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna6O35345 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna6O35345 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms